Est-il obligatoire d'avoir un logiciel de facturation en tant qu'auto-entrepreneur ?

Aucun texte de loi n'impose aujourd'hui à un auto-entrepreneur d'utiliser un logiciel de facturation. Il reste techniquement possible d'éditer ses factures sur Word ou Excel, à condition de respecter toutes les mentions légales obligatoires.En revanche, la réforme de la facturation électronique rend cette question obsolète à partir de septembre 2026, et ce quel que soit votre régime de TVA. En effet, la réforme vous concerne, que vous soyez assujetti à la TVA ou en franchise en base (article 293 B du CGI).Ce que la réforme de la facturation électronique impose concrètement aux auto-entrepreneurs : dès le 1ᵉʳ septembre 2026 : obligation d'être en capacité de recevoir des factures électroniques via une Plateforme Agréée par l'État ; dès le 1ᵉʳ septembre 2027 : obligation d'émettre des factures électroniques et de transmettre vos données transactionnelles à l'administration fiscale. Un simple PDF envoyé par e-mail ne sera plus valide : les formats imposés sont le Factur-X, l'UBL et le CII. Seule une Plateforme Agréée immatriculée par la DGFiP peut les générer et les transmettre.En pratique, un auto-entrepreneur qui n'utilise pas de logiciel de facturation conforme au 1ᵉʳ septembre 2026 ne sera pas en mesure de recevoir les factures de ses fournisseurs. Le choix d'un outil n'est donc plus optionnel.Qonto est déjà une Plateforme Agréée : son logiciel de facturation permet dès maintenant d'émettre et de recevoir des factures électroniques en illimité et gratuitement, avec un suivi des impayés, un rapprochement bancaire automatique et une synchronisation avec votre logiciel de comptabilité.

Quel logiciel de devis et factures choisir pour facturer en tant qu’auto-entrepreneur ?

Plusieurs logiciels de devis et factures disponibles sur le marché sont simples à utiliser pour un auto-entrepreneur.Par exemple : Qonto, qui est connu pour son compte professionnel mais qui propose aussi un logiciel de facturation gratuit 100 % adapté aux besoins des micro-entrepreneurs ; Indy, qui permet aux indépendants de gérer leur comptabilité et leur facturation dans le même outil ; Abby, qui estime le chiffre d’affaires et les cotisations Urssaf en plus d’intégrer un livre des recettes et un registre des achats ; Tiime, qui propose un module de facturation illimité et des alertes de dépassement des seuils.

Est-ce légal de faire ses factures sur Excel ?

Il est toujours possible de faire ses factures sur Excel, mais ce n’est pas recommandé. La facturation via Excel ou Word vous expose à plusieurs risques : oubli des mentions légales obligatoires ; erreur de numérotation ou de calcul ; absence d’archivage sécurisé ; difficulté de traçabilité en cas de contrôle. De même, Excel n’est pas un outil conforme à la réforme sur la facturation électronique qui entrera en vigueur en septembre 2026. Mieux vaut choisir dès à présent une Plateforme Agréée par l’État, comme Qonto.

Comment créer une facture avec ou sans TVA en micro-entreprise ?

Votre statut définit la manière dont vous devez créer une facture avec ou sans TVA en micro-entreprise : si vous êtes en franchise en base de TVA, il ne faut pas la facturer. Vous devez ajouter la mention « TVA non applicable – article 293 B du CGI » ; si vous êtes assujetti à la TVA, vous devez faire apparaître le taux de TVA applicable, le montant HT, le montant de TVA et le total TTC. Un bon logiciel de facturation doit vous permettre de gérer ces deux cas.

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Top 10 des logiciels de facturation gratuits pour auto-entrepreneur

Comparer les logiciels de facturation gratuits

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À retenir Comparatif des meilleurs logiciels de facturation gratuits pour auto-entrepreneur Quel est le meilleur logiciel de facturation gratuit pour un auto-entrepreneur ? Qonto Tiime Facture.net Shine Facture Henrri Abby My Facturation Indy FNAE Gestion Sinao Comment choisir le bon logiciel de facturation pour auto-entrepreneur ?

Traitement des factures 50% + rapide

Devis et factures automatisés : gagnez plus de 11h/mois

4.5 sur Capterra

Gérer vos factures

Émettre une facture conforme, claire et professionnelle ne devrait jamais être compliqué, même sans budget.

Heureusement, il existe aujourd’hui des logiciels de facturation gratuits, parfaitement adaptés aux micro-entrepreneurs. Ils permettent de créer des devis, suivre ses paiements et se conformer aux obligations légales en quelques clics.

Encore faut-il choisir le bon outil. Découvrez notre comparatif des 10 meilleurs logiciels de facturation gratuits pour auto-entrepreneur.

À retenir

Plusieurs logiciels de facturation gratuits sont accessibles aux auto-entrepreneurs, comme Qonto, Henrri ou Tiime.
À partir du 1ᵉʳ septembre 2026, tout auto-entrepreneur devra pouvoir recevoir des factures électroniques via une Plateforme Agréée.
Tester l’ergonomie et comparer les fonctionnalités disponibles reste la meilleure façon de trouver un outil adapté à sa micro-entreprise.
Qonto est un logiciel de facturation gratuit pour auto-entrepreneur agréé par l’État et conforme avec la réforme de la facturation électronique.

Facturer gratuitement avec Qonto Facturation

Comparatif des meilleurs logiciels de facturation gratuits pour auto-entrepreneur

Logiciel de facturation	Plateforme Agréée	Devis et factures illimités	Synchronisation bancaire	Suivi de trésorerie	Application mobile	Note Trustpilot
Qonto	✅	✅	✅	✅	✅	4,8/5
Tiime	✅	✅	🟠	✅	✅	4,8/5
Abby	✅	✅	🟠	✅	✅	4,4/5
Facture.net	❌ (Partenariat)	✅	❌	❌	❌	4,7/5
Shine Facture	✅	🟠	✅	✅	✅	4,7/5
Henrri	❌ (Partenariat)	✅	🟠	✅	❌	4,5/5
Indy	✅	✅	✅	✅	✅	4,8/5
My Facturation	❌ (Partenariat)	✅	🟠	🟠	❌	-
FNAE Gestion	❌ (Partenariat)	✅	❌	🟠	❌	3,7/5
Sinao	❌ (Partenariat)	❌	🟠	✅	✅	2,5/5

Légende :

✅ Disponible

🟠 Disponible en version payante

❌ Non disponible

Traitement des factures 50% + rapide

Devis et factures automatisés : gagnez plus de 11h/mois

4.5 sur Capterra

Gérer vos factures

Quel est le meilleur logiciel de facturation gratuit pour un auto-entrepreneur ?

Voici 10 logiciels de facturation 100 % gratuits adaptés aux besoins spécifiques des micro-entrepreneurs :

Qonto ;
Tiime ;
Facture.net ;
Shine Facture ;
Henrri ;
Abby ;
My Facturation ;
Indy ;
FNAE Gestion ;
Sinao.

Qonto

Note Trustpilot : 4,8/5 ⭐

Le logiciel de facturation de Qonto est proposé aux auto-entrepreneurs gratuitement, même s’ils ne détiennent pas encore de compte professionnel.

Ce que vous pouvez faire avec le logiciel de facturation gratuit de Qonto :

créer des devis et des factures conformes en quelques clics ;
générer des factures et des devis personnalisés en illimité ;
envoyer automatiquement des relances pour éviter les retards de paiement ;
suivre l’état des factures en temps réel ;
connecter vos comptes bancaires externes pour un suivi global de votre trésorerie ;
centraliser vos justificatifs et suivre vos dépenses professionnelles.

Avantage principal : Une interface ergonomique et un logiciel tout-en-un qui simplifie la gestion quotidienne des auto-entrepreneurs.

Limite : Certaines fonctionnalités avancées sont liées à l’ouverture d’un compte pro Qonto.

Qonto ne propose pas qu’un logiciel de facturation gratuit aux auto-entrepreneurs. En optant pour le compte pro, vous pouvez également :

bénéficier de cartes de paiement 100 % paramétrables ;
recevoir des virements instantanés et payer vos fournisseurs facilement ;
piloter votre trésorerie, accéder à des offres de financement partenaires ;
connecter vos outils préférés à votre compte pro grâce à plus de 15 000 intégrations disponibles.

Qonto est reconnu par l’État comme Plateforme Agréée (PA), anciennement Plateforme de Dématérialisation Partenaire (PDP), ce qui garantit la conformité avec la réforme de la facturation électronique à venir.

Tiime

Note Trustpilot : 4,8/5 ⭐

Tiime est une solution de facturation gratuite parfaitement adaptée aux micro-entrepreneurs à la recherche d’un outil simple à utiliser.

Ce que vous pouvez faire avec le logiciel de facturation gratuit de Tiime :

créer des devis et des factures personnalisés (logo, couleurs, mentions légales) ;
suivre votre chiffre d’affaires à l’aide d’un tableau de bord ;
donner accès gratuitement à vos données de facturation électronique à votre expert-comptable ;
accéder à l’outil depuis votre smartphone ou un navigateur web.

Avantage principal : Le module de facturation est illimité et conforme, avec en prime le suivi des performances en temps réel et des alertes de dépassement des seuils.

Limite : Les fonctionnalités de synchronisation bancaire illimitée, de recouvrement des factures impayées ou de signature électronique des devis sont réservées aux abonnements payants (à partir de 17,99 € HT/mois).

Ergonomique et mobile, cet outil est idéal pour les auto-entrepreneurs qui se déplacent régulièrement pour leur activité professionnelle.

Facture.net

Note Trustpilot : 4,7/5 ⭐

Facture.net est un logiciel de facturation 100 % gratuit qui inclut également un CRM pour gérer facilement ses clients.

Ce que vous pouvez faire avec le logiciel de facturation gratuit de Facture.net :

créer facilement des devis et factures personnalisables ;
retrouver ses documents grâce à un moteur de recherche adapté ;
gérer ses clients et ses prestations depuis un tableau de bord clair ;
suivre l’état des factures en quelques clics.

Avantage principal : Facture.net est totalement gratuit. C’est le logiciel de facturation idéal pour les auto-entrepreneurs et les dirigeants qui créent leur entreprise.

Limite : Il n’existe pas d’application mobile pour gérer sa facturation avec cette solution. De plus, le logiciel affiche des publicités.

Facture.net n’est pas une Plateforme Agréée mais dispose d’un partenariat avec Super PDP.

Shine Facture

Note Trustpilot : 4,7/5 ⭐

Shine Facture propose un logiciel de facturation en ligne aux auto-entrepreneurs et aux freelances. Ce dernier peut être utilisé indépendamment du compte pro Shine.

Ce que vous pouvez faire avec le logiciel de facturation gratuit de Shine Facture :

émettre des devis et des factures électroniques en illimité ;
éditer des factures en français, anglais, allemand ou néerlandais ;
réconcilier vos factures avec vos transactions bancaires ;
exporter vos flux financiers, vos reçus et vos factures.

Avantage principal : Les fonctionnalités proposées sont complètes et permettent aux micro-entreprises de gérer facilement leur facturation électronique.

Limite : Vous ne pouvez pas convertir vos devis en factures ou facturer plus de 5 clients par mois avec l’offre gratuite.

Comme Qonto, Shine Facture est une Plateforme Agréée par l’État.

Henrri

Note Trustpilot : 4,5/5 ⭐

Avec Henrri, les auto-entrepreneurs peuvent émettre un nombre illimité de factures et de devis gratuitement.

Ce que vous pouvez faire avec le logiciel de facturation gratuit d’Henrri :

convertir les devis en factures en 1 clic ;
personnaliser les factures en y ajoutant le logo ou les mentions légales ;
gérer les acomptes ;
relancer les clients pour éviter les impayés.

Avantage principal : Développé par le Groupe Rivalis, ce logiciel gratuit pour auto-entrepreneur répond aux besoins essentiels de facturation.

Limite : Il n’est pas possible de personnaliser à 100 % ses documents avec le plan gratuit (fonctionnalité disponible avec l’offre Expert, à partir de 17 € HT/mois).

Henrri n’est pas une Plateforme Agréée mais dispose d’un partenariat avec Pennylane.

Abby

Note Trustpilot : 4,4/5 ⭐

Abby propose gratuitement un logiciel de facturation pour freelance et pour auto-entrepreneur, combiné à des fonctions comptables.

Ce que vous pouvez faire avec le logiciel de facturation gratuit d’Abby :

créer des devis et des factures en illimité ;
personnaliser les documents ;
accéder à un livre des recettes et des achats ;
obtenir une estimation de chiffre d’affaires à déclarer auprès de l’Urssaf.

Avantage principal : Abby offre un bon compromis entre facturation et outil comptable pour les micro-entrepreneurs.

Limite : Certaines options nécessitent de passer à la version payante, comme le retrait du logo Abby des factures, la gestion des factures récurrentes ou les relances automatiques.

L’interface d’Abby a été conçue pour permettre aux auto-entrepreneurs de créer leurs factures en moins de deux minutes.

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My Facturation

Note Trustpilot : na

My Facturation est un logiciel pour auto-entrepreneur qui combine à la fois un module de facturation gratuit et des modules payants pour piloter sa micro-entreprise en détail.

Ce que vous pouvez faire avec le logiciel de facturation gratuit de My Facturation :

créer des devis et des factures sans frais ;
suivre les règlements via un tableau de bord ;
gérer des clients et des produits en illimité.

Avantage principal : My Facturation propose un ensemble d’outils dédiés à la facturation, à la gestion et à la comptabilité pour simplifier le quotidien des auto-entrepreneurs.

Limite : Il faut souscrire au module Personnalisation (4,99 € HT/mois) pour ajouter ses logos, couleurs et mentions personnalisés sur ses devis, factures et e-mails.

My Facturation propose aussi un logiciel de facturation pour TPE et un logiciel de facturation pour PME.

Indy

Note Trustpilot : 4,8/5 ⭐

Indy propose une solution de gestion complète pour les indépendants, dont un module de facturation gratuit qui répond aux besoins des auto-entrepreneurs.

Ce que vous pouvez faire avec le logiciel de facturation gratuit d’Indy :

créer et personnaliser des devis et des factures sans limite ;
transformer des devis en factures en un clic ;
suivre les paiements et les impayés ;
générer un catalogue de produits et services.

Avantage principal : Apprécié pour sa simplicité d’utilisation, ce logiciel pour auto-entrepreneur est une solution évolutive qui va au-delà de la facturation.

Limite : Les factures récurrentes, les relances automatiques en cas d’impayé et la signature électronique des devis ne sont disponibles qu’avec l’offre Plus, à partir de 9 € HT/mois.

Conforme avec la future réforme de la facturation électronique, Indy intègre d’autres fonctionnalités pour les auto-entrepreneurs qui veulent aller plus loin. Parmi elles, le suivi de la trésorerie, un compte professionnel ou encore la synchronisation bancaire.

FNAE Gestion

Note Trustpilot : 3,7/5 ⭐

FNAE Gestion propose un logiciel de gestion et de facturation pour auto-entrepreneur. Son objectif : vous permettre de facturer vos clients et de piloter votre activité en temps réel.

Ce que vous pouvez faire avec le logiciel de facturation gratuit de FNAE Gestion :

émettre des devis et factures en illimité ;
personnaliser le style, les couleurs ou la police de vos factures ;
gérer son fichier clients et prospects ;
suivre les impayés.

Avantage principal : FNAE Gestion vous permet de déclarer directement votre chiffre d’affaires à l’Urssaf.

Limite : Les factures d’acompte, les avoirs ou les factures avec débours sont disponibles uniquement à partir de l’offre Infinity (9,90 € TTC/mois). De même, la gestion de la TVA est disponible via une option supplémentaire.

En optant pour l’abonnement Infinity, vous pouvez aussi adhérer à la FNAE pour participer à la défense du régime de l’auto-entrepreneur.

Sinao

Note Trustpilot : 2,5/5 ⭐

Les auto-entrepreneurs peuvent créer des factures électroniques et suivre facilement leurs contrats et leurs ventes jusqu’au paiement avec Sinao.

Ce que vous pouvez faire avec le logiciel de facturation gratuit de Sinao :

créer et éditer des factures personnalisées au format Factur-X ;
suivre l’état des factures jusqu’au paiement de vos clients ;
calculer, déclarer et payer votre TVA ;
suivre les finances de votre entreprise.

Avantage principal : Sinao est disponible 100 % en ligne. Que vous exerciez votre activité au bureau ou en déplacement, vous pouvez facturer vos clients depuis un ordinateur, un mobile ou une tablette.

Limite : Le logiciel de facturation gratuit de Sinao permet aux auto-entrepreneurs de réaliser seulement 5 factures de vente par mois. De même, sa note Trustpilot est plus basse que la moyenne.

Sinao n’est pas une Plateforme Agréée mais dispose d’un partenariat avec la PA Qonto.

Comment choisir le bon logiciel de facturation pour auto-entrepreneur ?

Pour faire le meilleur choix de logiciel possible, vous devez notamment :

évaluer les besoins de votre entreprise ;
vérifier la conformité du logiciel ;
tester l’ergonomie de l’outil ;
comparer les fonctionnalités gratuites et les options payantes.

Évaluer les besoins de son entreprise

Tout d’abord, analysez le fonctionnement de votre micro-entreprise. Vos réponses vous orienteront naturellement vers certains outils plutôt que d'autres.

Posez-vous les bonnes questions :

Combien de factures sont émises chaque mois ?
Les prestations sont-elles récurrentes ?
Faut-il relancer les clients manuellement ou de manière automatique ?
Un accès mobile est-il nécessaire pour créer des factures en déplacement ?
Un outil dédié à la facturation est-il suffisant ou faut-il un écosystème plus large (comptabilité, note de frais, compte pro, etc.) ?

Vérifier la conformité du logiciel

Un logiciel de facturation gratuit pour auto-entrepreneur doit impérativement respecter certaines règles pour que vos documents soient valides aux yeux de l’administration fiscale.

Par exemple, il doit :

générer des numéros de facture uniques et chronologiques ;
assurer un archivage des documents conforme ;
respecter le RGPD pour la gestion des données personnelles des clients.

Avec l’entrée en vigueur de la réforme sur la facturation électronique qui approche, il est vivement conseillé de choisir un logiciel reconnu comme Plateforme Agréée, comme Qonto.

Découvrir la liste des Plateformes Agréées par l’État

Tester l'ergonomie de l’outil

Un logiciel peut être complet et conforme, mais inutilisable si son interface est trop complexe. L’ergonomie est un critère crucial, surtout pour les auto-entrepreneurs qui n’ont pas le temps d’explorer des fonctionnalités techniques.

Testez les points suivants :

la facilité de création d’une facture ou d’un devis ;
la personnalisation des documents ;
la qualité de l’interface ;
l’existence d’une version mobile ;
la réactivité du support client.

Comparer les fonctionnalités gratuites et les options payantes

Certains logiciels se disent gratuits mais réservent des fonctions essentielles à des formules payantes.

Avant de vous engager, vérifiez les éléments suivants :

Quelles sont les fonctionnalités incluses dans la version gratuite ?
L’outil est-il limité en nombre de factures ou de clients ?
Que se passe-t-il si l’activité se développe ?
Le passage à une formule supérieure est-il simple et transparent ?

Vous cherchez une solution fiable et conforme pour facturer vos clients ? Testez le logiciel de facturation gratuit de Qonto sans attendre. Vous pourrez suivre votre chiffre d’affaires en temps réel, garder un œil sur votre trésorerie et obtenir un compte professionnel, le tout dans un seul et même outil.

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Questions fréquentes

Pourquoi utiliser un logiciel de facturation gratuit quand on est auto-entrepreneur ?

S’il est tentant de gérer sa facturation manuellement à l’aide d’un tableur comme Excel ou Google Sheets, cette méthode artisanale montre rapidement ses limites.

Même si l’adoption d’un logiciel de facturation n’est pas encore obligatoire, il présente de sérieux avantages, que ce soit sur le plan légal, organisationnel ou stratégique.

1. Le respect des obligations légales

Même en micro-entreprise, la facturation est encadrée par la loi. Chaque facture doit comporter un certain nombre de mentions obligatoires, comme :

le numéro de la facture ;
la date d’émission ;
l’identité complète du client et du prestataire ;
la description précise des biens ou services vendus ;
le prix hors taxe, le taux et le montant de la TVA (le cas échéant).

Attention, une amende de 15 € par mention manquante peut s’appliquer en cas d’erreur ou d’oubli.

L’utilisation d’un logiciel de facturation vous aide à éviter ces écueils. Il intègre automatiquement les mentions requises, génère des numéros de facture cohérents, applique les bonnes règles de TVA selon votre régime, et sécurise l’archivage des documents.

Autrement dit, vous restez en conformité avec la législation sans y penser.

Bon à savoir : Tout assujetti qui n’émet pas de facture électronique alors qu’il doit le faire s’expose à une amende de 50 € par facture non conforme, dans la limite de 15 000 € maximum/an.

2. Un gain de temps quotidien

Émettre une facture à la main, copier les coordonnées du client, recalculer le montant ou ajuster les dates, ces tâches administratives répétitives peuvent rapidement devenir chronophages, surtout lorsqu’on multiplie les missions.

Un logiciel de facturation pour auto-entrepreneur permet d’automatiser ces processus pour gagner un temps précieux :

les coordonnées et mentions légales sont préremplies ;
les prestations peuvent être enregistrées pour être réutilisées ;
les devis se transforment en factures en un clic ;
des modèles de documents sont disponibles et personnalisables ;
les relances peuvent être programmées.

Résultat : vous passez moins de temps à gérer l’administratif, et plus de temps à vous consacrer à votre cœur de métier.

3. Un meilleur suivi de son activité

Suivre son chiffre d’affaires est essentiel pour tout micro-entrepreneur. Cela permet de :

respecter les plafonds de la micro-entreprise ;
anticiper les déclarations mensuelles ou trimestrielles à l’Urssaf ;
détecter un éventuel passage au régime réel ou à l’assujettissement à la TVA.

Les meilleurs logiciels de facturation gratuits pour auto-entrepreneur intègrent un tableau de bord qui permet de voir en temps réel le chiffre d’affaires encaissé ou d’obtenir un historique complet des ventes.

Bon à savoir : En 2026, le plafond de chiffre d’affaires annuel à respecter pour être éligible au régime fiscal de la micro-entreprise est de 83 600 € pour les prestations de services, et de 203 100 € pour les activités de vente de marchandises.

Disclaimer

Les informations mentionnées dans cet article sur la comparaison des logiciels de facturation gratuits pour auto-entrepreneur ont été rassemblées après une recherche approfondie sur les sites web des fournisseurs respectifs en juillet 2026 et en toute bonne foi. Qonto n'est pas responsable de l'exactitude complète de toutes les informations, car les prix et les services peuvent changer au fil du temps. Nous faisons de notre mieux pour que toutes les informations soient toujours à jour. Nous vous invitons toutefois à vous informer par vous-même avant de prendre une décision finale.

ÉCRIT PAR

Jennifer Arnoux

Jennifer est copywriter depuis 2012 et écrit notamment pour Qonto. Titulaire d’un M2 entrepreneuriat, elle aide les indépendants et PME à comprendre les subtilités financières et juridiques qui les entourent.